1. Obecně o programu
Program provádí veškerou administrativu související s naturální a účetní evidencí až 99 samostatných skladů až pro 99999 různých skladových karet, kdy jedna karta může obsahovat nekonečné množství cenových a exspiračních modifikací. Evidence může být vedena v reálných nebo průměrných cenách. Přechod od jednoho systému ke druhému je v průběhu zpracování možný. Vedle skladových (nákupních) cen lze sledovat i ceny prodejní.
Program zohledňuje, zda uživatel je nebo není plátcem DPH. Při změně z neplátce na plátce či naopak lze jednoduše přecenit sklad (snížit či zvýšit hodnotu skladovaných položek o sazbu DPH).
Je zajištěna kompletní evidence zakázek od jejího zápisu, přes výdej skladovaného materiálu, zápis provedených prací až po finální vyúčtování zakázky, tisk daňového dokladu a zpracování nejrůznějších přehledů o rozpracovaných nebo již vyúčtovaných zakázkách. 
Program lze provozovat v síti. S ohledem na přidělená přístupová práva lze zajistit, aby si uživatelé navzájem nekonkurovali a nezasahovali do údajů, pro jejichž změnu nemají oprávnění.

2. Skladová evidence
V programu lze evidovat až 99 samostatných skladů  metodou FIFO (First In / First Out - první dovnitř / první ven). Každá skladovaná položka má přidělený jednoznačný kód -  pětimístné číslo skladové karty. Lze evidovat až 99999 různých skladových karet. Jedna karta může obsahovat nekonečné množství cenových a exspiračních modifikací. To znamená, že stejný kód skladové karty se používá pro položky skladované na různých skladech, s různou nákupní cenou, datem exspirace, sazbou DPH apod. Podle prvních dvou čísel se skladové karty člení do logických skupin.
Pro každý z definovaných skladů se eviduje odděleně počáteční zásoba, příjmy, výdeje (případně jejich storna) a aktuální stav skladů. Příjmy jsou rozlišeny podle: sklad, typ příjmu (způsob nabytí), datum, typ suroviny, surovina, dodavatel, dodací doklad / faktura. Výdeje jsou rozlišeny podle: sklad, typ výdeje, datum, typ suroviny, surovina, činnost, učební obor, číslo zakázky, odběratel, číslo žádanky.
Automaticky se provádí haléřové dorovnání příjemky na celkovou částku na dokladu, příp. dorovnání příjemek od jednoho dodavatele na celkovou částku faktury. Veškeré halířové rozdíly vzniklé při příjmu zboží, zaokrouhlením, množstevní slevou, přepočtem průměrné ceny atd. se provádějí jedinou skladovou kartou cenového vyrovnání. Ta jediná může být přijata, vydána i skladována v záporné hodnotě. Program provádí všechny tyto operace automaticky.
Jedním zápisem lze zaznamenat příjem a okamžitý výdej položek - "průchodka" (skladem projde jen účetně), převádět zboží ze skladu do skladu apod. Výdejky lze zapisovat "ručně" a zvolit "typ výdeje" (na zakázku / spotřeba / prodej / neinvestiční majetek / dary / obaly / převod / likvidace). Můžeme také použít tzv. "normování" - výroba vlastních výrobků, kdy program připraví výdejku materiálu na zadaný počet zvolených výrobků.
Pro skladované položky lze evidovat minimální a maximální zásobu, prodejní ceny (pevné či koeficientem), celkem přijaté a vydané množství za rok, za kolik jste od počátku roku odebrali od určitého dodavatele, kolik odebrali různí odběratelé a zobrazit či vytisknout řadu dalších přehledů. Je možné provádět i tzv. "přecenění skladů" - při skutečném přecenění položek na skladě nebo pokud se stanete plátcem nebo naopak neplátcem DPH.
Pohyby na skladech lze rozlišovat účetním obdobím, za které lze provádět měsíční / roční uzávěrky. Při uzávěrce se příjemky, výdejky a jejich případná storna za uzavírané účetní období odkládají do samostatné složky a přepočítává se nová počáteční zásoba. Při roční uzávěrce se navíc nastavuje počáteční číslování dokladů.

3. Ceny
Položky na skladech můžeme evidovat buď v reálných nebo v průměrných cenách. Pokud evidujete sklad v reálných cenách, pak se v rámci jedné skladové karty (jednoho evidenčního čísla) evidují na skladě samostatně položky s odlišnou cenou za měrnou jednotku, s odlišným datem exspirace resp. s odlišnou sazbou DPH. Při příjmu zboží se přijaté množství přičte k původní zásobě jen tehdy, když souhlasí kód skladové karty, cena za měrnou jednotku, datum exspirace a sazba DPH. V opačném případě se přijímané zboží zaznamená na sklad jako samostatná položka. Při výdeji se nabízejí skladované položky tak, že nejstarší materiál se nabízí k výdeji vždy jako první. Můžete si ale vždy vybrat, kterou ze skladovaných položek budete v konkrétním případě vydávat.
Při evidenci skladu v průměrných cenách je každá skladová karta v příslušném skladu a se stejnou sazbou DPH maximálně jednou. Při dalším příjmu zboží, které je již na skladě, se vždy přepočítá aktuální skladová cena za měrnou jednotku (nová cena je váženým průměrem cen). Případné haléřové rozdíly, které mohou vzniknout vlivem zaokrouhlení, se zapisují na skladovou kartu "Cenové vyrovnání". Při výdeji určitého zboží není možné vybírat, zda vydáte to, které je na skladě již měsíc nebo to, které jste přijali dnes, resp. zda vydáte levnější nebo dražší položku. Všechno zboží se stejnou sazbou DPH (určitá skladová karta) je na skladě "na jedné hromádce" s průměrnou cenou. Zvolený systém cen - reálné / průměrné - se týká tzv. "skladových" cen, tj. cen, za které jsou položky evidované na počáteční zásobě, na příjemkách, výdejkách a na aktuálním stavu skladů.
Kromě skladové ceny (ceny, za kterou jste zboží nakoupili a se kterou ho evidujete na skladu) si můžete pro každou skladovou kartu nastavit také "prodejní" cenu. Prodejní cena se uplatňuje při výdeji "Na zakázku" nebo "Na prodej". V zakázkách se obvykle účtuje materiál v prodejních cenách.  Vyjímkou je případ, kdy zákazník je typu "Z" - zaměstnanec. Pak se účtuje v skladových cenách.
Prodejní cena  může být nastavena "koeficientem" skladové ceny nebo jako "pevná" prodejní cena. U každé skladové karty můžete nastavit jiný koeficient nebo jinou pevnou (absolutní) cenu. Zadání koeficientu 0 (nula) pro určitou skladovou kartu znamená, že tato karta má "pevnou" prodejní cenu, jejíž konkrétní hodnotu si nastavíte předem v číselníku karet nebo ji změníte v okamžiku výdeje. "Pevná" prodejní cena je konkrétní pevná částka, která nezávisí na ceně skladové (položka se prodává vždy za stejnou cenu).
Skladová karta, která má nastaven koeficient různý od nuly, je karta, která má prodejní cenu určenou "koeficientem" ceny skladové. Skladová cena se pak vynásobí příslušným koeficientem. Zadáním koeficientu např. 1,15 se bude materiál vydávaný na zakázku nebo na prodej účtovat vždy v prodejní ceně o 15% vyšší než byla konkrétní skladová cena v okamžiku výdeje. Koeficient prodejních cen lze nastavit individuálně nebo hromadně pro všechny karty nebo pro vybranou skupinu karet. Pokud používáte prodejní ceny, je pak možné sledovat tzv. "hrubý zisk z prodeje", tj. rozdíl mezi cenou skladovou a prodejní.

4. DPH - plátce / neplátce
Program řeší problematiku evidence skladu a zakázek pro neplátce i plátce DPH a také případnou změnu z neplátce na plátce nebo naopak. Pokud organizace  není  plátcem DPH,  evidují se položky na skladech včetně DPH. Pro plátce DPH se položky evidují bez DPH. U každé položky se vždy eviduje  příslušná sazba DPH - na příjemce, výdejce i na skladech. Když se přijímá na sklad od  neplátce DPH,  je sazba vždy 0 procent - nelze uplatnit odpočet. Když se na sklad přijímá od plátce DPH, převezme se sazba DPH pro příslušnou položku (skladovou kartu) z číselníku skladových karet a tato sazba se zapíše na příjemku i do skladu. Při zápisu příjemky můžete zadávat cenu bez nebo s DPH a jednoduše přičíst nebo odečíst odpovídající DPH od zadané ceny.
Když změníte nastavení parametru zda jste nebo nejste plátcem DPH, máte nárok na tzv. "mimořádné přecenění skladu".  Evidovaný stav na skladě můžete snížit resp. zvýšit o příslušnou sazbu DPH.
Pro plátce DPH se při vyúčtování zakázek vytvářejí odpovídající daňové doklady (faktury resp. pokladní doklady) s příslušným rozpisem DPH.

5. Evidence zakázek
Je zajištěna kompletní evidence zakázek od jejího zápisu, přes výdej skladovaného materiálu, zápis provedených prací až po finální vyúčtování zakázky, tisk daňového dokladu a zpracování nejrůznějších přehledů o rozpracovaných nebo již vyúčtovaných zakázkách. 
Dříve než začnete zapisovat první zakázku, je nutné si nastavit v programu některé parametry:
•	definovat střediska (název, adresa, IČO, DIČ, číslo účtu, typ - autoservis ANO / NE)
•	nastavit texty, které se vypisují na zakázkovém listě resp. na daňovém dokladu
•	naplnit pomocné číselníky prácí a úkonů, přijímacích techniků, mistrů pracujících na zakázkách
•	nastavit koeficienty prodejních cen nebo pevné prodejní ceny
Nyní si na následujícím příkladu ukážeme postup prací na zakázkách. Nejprve založíme tzv. "zakázkový list" - zapíšeme novou zakázku. Program zakázce přidělí jednoznačné číslo v rámci střediska a účetního roku. Číslo, které má být přiděleno první zakázce, zadáváme při zápisu střediska. Zapíšeme údaje o zákazníkovi: jméno, adresa, způsob platby (hotově / převodem / zaměstnanec - účtuje se ve skladových cenách), kontaktní telefon. Pokud zapisujeme zakázku do střediska typu "autoservis", zapíšeme také údaje o vozidle: typ, SPZ, stav tachometru, paliva, čísla motoru a podvozku, výbava vozidla. Dále zapíšeme požadovaný rozsah zakázky (opravy). Rozsah zakázky lze zapisovat jako zcela volný text nebo vybíráme požadované práce a materiál, který se má vydat na zakázku, z číselníku prací a skladových karet (program pak může spočítat předběžnou cenu zakázky). Zápis dokončíme zadáním technika, který převzal zakázku, data převzetí, termínu dokončení, potvrzením předběžné ceny a případně složené zálohy. Zakázkový list vytiskneme v potřebném počtu kopií a zapíšeme ho do evidence. Nyní je zakázka ve stavu "rozpracovaná" a můžeme na ni vydávat materiál. Podle potřeby lze zakázkový list opravovat - měnit rozsah, předběžnou cenu, termíny, opravit či doplnit údaje o zákazníkovi apod. Kdykoli se lze také podívat na stav rozpracované zakázky - za kolik Kč již byl na zakázku vydaný materiál, zda nebyla výrazně překročena předběžná cena či termín předání apod. Je-li zakázka dokončena a připravena k předání zákazníkovi a byly již zapsané všechny výdejky na tuto zakázku, lze zakázku vyúčtovat. V okamžiku vyúčtování zapisujeme (potvrzujeme) již jen provedené práce (jejich množství a cenu). Materiál vydaný na zakázku lze zadat pouze zápisem odpovídající výdejky. Při vyúčtování si vytiskneme odpovídající daňový doklad (fakturu nebo pokladní doklad) a zakázku můžeme ještě nechat ve stavu "rozpracovaná". Např. proto, že jsme zakázku ještě fyzicky nepředali zákazníkovi a až při vlastním předání zjistíme, že je nutné ji ještě o některé položky doplnit nebo naopak vyřadit položky, které si zákazník nepřál. Pouze "rozpracovanou" zakázku lze takto jednoduše opravit a znovu vyúčtovat. Zakázka, kterou při vyúčtování prohlásíme za definitivně vyúčtovanou, je již uzavřená a jen velmi obtížně ji lze stornovat nebo jinak opravovat. Všechny rozpracované i vyúčtované zakázky zůstávají v evidenci (i několik let), dokud je fyzicky nezrušíme. Vyúčtované zakázky lze kdykoli zpětně prohlížet, vytvářet a tisknout nejrůznější přehledy - podle zákazníků, mistrů, vozidel, nákladů, vydaného materiálu apod.
Protože program SKLADNÍK může být instalovaný na více počítačích v počítačové síti, mohou jednotlivé kroky při evidenci zakázek dělat různé osoby s odpovídajícími oprávněními. V praxi si lze představit např. tuto instalaci:
•	A - zásobovač - sleduje stav skladu a objednává zboží
•	B - sklad, příjem zboží - zapisuje příjem zboží do skladů
•	C - sklad, výdej zboží - zapisuje výdej zboží do skladů
•	D - kancelář - technik je v kontaktu se zákazníky, zapisuje nové zakázky, opravuje a připravuje k vyúčtování
•	E - pokladna - finální vyúčtování zakázek, tisk daňových dokladů a příjem hotovosti